一般研磨樹葉樹枝通常是用來提取DNA、RNA或是蛋白質(zhì),葉綠素等色素。葉綠素的提取用于研究植物的光合作用效率或健康狀態(tài)。也有化學(xué)成分檢測,例如生物堿,有機(jī)酸,揮發(fā)性油等。在充分了解客戶的實(shí)驗(yàn)具體需求后,綜合考量實(shí)驗(yàn)的精確性、高效性等因素,本次實(shí)驗(yàn)決定選用三維離心冷凍研磨儀來完成相關(guān)操作。
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/strong>對樹葉樹枝進(jìn)行研磨提取植物RNA用于后續(xù)轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒?yàn)。
工作原理:樣品通三維高速振蕩研磨樣品。
實(shí)驗(yàn)設(shè)備:凈信三維離心冷凍研磨儀主機(jī),研磨管、適配器。
冷凍研磨儀
實(shí)驗(yàn)過程:
樣品研磨實(shí)驗(yàn)步驟:
1.樹葉剪成1-2mm2的小塊,放入研磨管中。加入適量TRIzol試劑
2.提前15分鐘打開設(shè),啟動儀器和制冷開關(guān)。確保樣品在低溫中進(jìn)行。
3.設(shè)置參數(shù)18m/S,時間60S,間隔時間20S,研磨2次
4.研磨完成取出研磨管,室溫靜置3分鐘。
RNA提取操作:
1.每TRIzol試劑加入0.2 mL氯仿,迅速蓋緊管蓋,用手劇烈振蕩。室溫靜置2-3分鐘,使混合物分層。
2.將研磨管放入離心機(jī),設(shè)置離心參數(shù)4,000 × g,離心15分鐘(4°C條件下)。
3.離心后,混合物分為三層:上層:無色水相(含RNA)。中間層:白色蛋白相。下層:紅色有機(jī)相(含DNA和蛋白質(zhì))
RNA沉淀:
1、小心吸取上層水相,轉(zhuǎn)移至新的1.5 mL離心管中。
2、加入等體積異丙醇,輕輕顛倒混勻。室溫靜置10分鐘,使RNA沉淀。
3、4°C條件下,12,000 × g離心10分鐘,棄上清。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
樹枝樹葉研磨前后效果對比圖
本次實(shí)驗(yàn)采用三維離心冷凍研磨儀處理凍干后的樹枝樹葉效果非常好,可以批量、高效,均一處理樣品,樣品處理好可以直接進(jìn)入下一步驟,方便快捷。